Эфиопиядағы SARS-COV-2 анықтау үшін төрт нуклин қышқылының күшейтілуін орындау

Worlder.com сайтына кіргеніңіз үшін рахмет. Сіз CSS қолдауымен шолғыш нұсқасын қолданып жатырсыз. Жақсы тәжірибе үшін жаңартылған шолғышты пайдалануды ұсынамыз (немесе Internet Explorer-де үйлесімділік режимін өшіріңіз). Сонымен қатар, тұрақты қолдауды қамтамасыз ету үшін біз сайтқа стильдер мен JavaScriptсіз көрсетеміз.
Бірден үш слайдтың карусельін көрсетеді. Алдыңғы және келесі батырмаларды қолданып, үш слайдтардан бір уақытта жылжу үшін немесе үш слайдтар арқылы үш слайдтардан өту үшін жүгірткі түймелерін пайдаланыңыз.
2019 жылдан бастап Коронавирус ауруы (Covid-19) өршуден бастап бүкіл әлемде көптеген коммерциялық нуклеин қышқылының күшейтілуі тесттері (Nataats) дамыды және стандартты талдауға айналды. Бірнеше сынақтар тез дамып, зертханалық диагностикалық сынақтарға қолданылса да, осы сынақтардың жұмысы әр түрлі параметрлерде бағаланбаған. Сондықтан, бұл зерттеу Abbott Sars-Cars-Cars-2, Daan ген, BGI, BGI, BGI және Sansure Biotech компаниясының үлгерімін бағалауға бағытталған. Зерттеу Эфиопиялық денсаулық сақтау институтында (EPHI) 1-30 желтоқсан аралығында өтті. 164 Насофарингальды үлгілер Qiamamp RNNA MINI жинағы және ABBOTT ДНҚ-ны дайындау жүйесін қолдана отырып өндірілді. 164 үлгіден, 59,1% оң, 40,9% CRS үшін теріс болды. Biotech-тің позитивтілігі CRS-пен салыстырғанда едәуір төмен болды (P <0,05). Biotech-тің позитивтілігі CRS-пен салыстырғанда едәуір төмен болды (P <0,05). Положительные результаты Sansure Biotech Bilach Byli znachitelno Ниже по сравнению С CRS (P <0,05). Biotech-тің оң нәтижелері CRS (P <0.05) салыстырғанда едәуір төмен болды.与 CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低 (P <0.05).与 CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低 (P <0.05). У таламыЭк-ныло Овучительно Меньше положительных результатов по сравнению Sansure Biotech CRS (P <0.05) салыстырғанда оң нәтижелерге ие болды.Төрт талдаудың жалпы келісімі CRS-пен салыстырғанда 96,3-100% құрады. Төрт сахна салығы төмен позитивтілігімен қатар, төрт талдаудың орындалуы да салыстырылды. Осылайша, Сансура биотехникасы [тек зерттеу (RUO)] талдауы Эфиопияда қолдану үшін қосымша тексеруді қажет етеді. Соңында, қосымша зерттеулерді өндірушінің тиісті талаптарына сай бағалау қажет.
Зертханалық тестілеу - Дүниежүзілік денсаулық сақтау ұйымының (ДДСҰ) құрамына кіреді (ДДСҰ) 2019 (Ковид-19) Дайындық пен жауап (SPRP). Дәл осы елдерде дайындықты, жағдайды дұрыс басқаруды, кәмелетке толмағандарды, қырағылық және денсаулық сақтау проблемаларына жедел ден қою үшін зертханалық мүмкіндікті арттыру керек деп кеңес береді. Бұл зертхананың рөлі дамып келе жатқан инфекциялық агенттердің ауруы мен эпидемиологиясын сипаттау және олардың таралуын бақылаудың кілті болып табылады.
Ковид-19 диагнозы эпидемиологиялық және медициналық ақпаратты, жеке белгілерін / белгілерді, радиографиялық және зертханалық мәліметтерді қажет етеді2. Ковид-19-дан басталғандықтан, Вухан, Қытайдан, бүкіл әлемде көптеген коммерциялық нуклин қышқылының күшейтілген сынақтары (Nataats) шығарылды. Нақты уақыттағы кері транскрипция Полимераза тізбегі (RRT-PCR) 2 (Sars-Cov-2) 3 инфекцияның ауыр диагностикасы үшін күнделікті және стандартты әдіс ретінде пайдаланылды. SARS-COV-2-ді молекулалық анықтау, әдетте, N (Nucapsid Protein гені), e (конверт протеині гені), orf1a / b (RNA-тәуелді РНҚ полимеразы ген) гендері (ашық оқу жақтауы 1a / b). Вирустық геномнан ген) аймақ. Олар вирустық геномдардан табылған негізгі қоржындар болып саналады4. Осы гендердің ішінде RDRP және E гендері жоғары аналитикалық анықтама сезімталдығы жоғары, ал N гені төмен аналитикалық сезімталдыққа ие.
ПТР талдауының өнімділігі әртүрлі факторларға байланысты әр түрлі факторларға байланысты өзгеруі мүмкін, мысалы, экстракция реагенттері, күшейту / анықтау реагенттері, экстракция әдісі, ПТР машинасының сапасы және басқа аспаптардың сапасы. 2020 жылғы сәуірдегі жағдай бойынша тоғыз елден 48-ден астам түрлі диагностикалық құрылғылар Ковид-196 диагностикасы үшін төтенше жағдайды пайдалануға (EUA) алды. Эфиопияда 26 денсаулық сақтау мекемесінде, соның ішінде ABI 7500, ABBOTT M2000, Roche 48000 және Quant-Studio7-де ПТР-2-дегі ПТР платформалары 14-тен астам ПТР платформалары қолданылады. Сонымен қатар, ПТР-тің түрлі жиынтықтары, мысалы, Daan гендік тест, ABBOT SARS-COV-2 сынағы, Сансюриялық биотехникалық сынақ және SARS-COV-2 BGI сынағы. RRT-PCR өте сезімтал болса да, Covid-19-мен ауыратын кейбір науқастар жалған теріс нәтижелерге, алқаптағы вирустық рибонуклин қышқылының жеткіліксіз көшірмелеріне, көлікті, сақтауға, сақтауға және өңдеуге және зертханалық зерттеулерге байланысты. Персоналдың шарттары мен әрекеттері8. Сонымен қатар, бұрмалаушылық немесе бақылау, циклді (CT) бақылау, цикл (CT), басқа патогендік нуклеин қышқылдарымен немесе белсенді емес / қалдық SARS-CCR-2 RNNA RRT-PCR9-да жалған оң нәтижелерге әкелуі мүмкін. Осылайша, ПТР тестілері гендік фрагменттердің тасымалдаушыларын шынымен анықтай алатындығы, өйткені олар шынымен белсенді вирустық гендерді ажырата алмайды, сондықтан сынақтар тек емтихандарды да анықтай алады. Сондықтан, біздің параметрімізде стандартты әдістерді қолдана отырып, диагностикалық өнімділікті бағалау маңызды. Көптеген NAAT реагенттері Эфиопиялық денсаулық сақтау институтында (EPHI) және бүкіл ел бойынша қол жетімді болса да, олардың тиімділігін салыстырмалы бағалау әлі де жоқ. Сондықтан, бұл зерттеу клиникалық үлгілерді қолдана отырып, SARS-CCR-мен SARS-CCR анықтауға арналған коммерциялық жиынтықтардың салыстырмалы жұмыстарын бағалауға бағытталған.
Бұл зерттеуге Ковид-19 күдіктінің барлығы 164 қатысушы кірді. Үлгілердің көпшілігі емдеу орталықтарынан болды (118/164 = 72%), ал қалған 46 (28%) қатысушылар емделмейтін орталықтардан болған. Орталықта емделмеген қатысушылар арасында 15 (9,1%) клиникалық тұрғыдан күдікті жағдайларға және 31 (18,9%) расталған істер бойынша байланыстарға ие болды. Тоқсан үш (56,7%) қатысушылар ерлер болды, ал қатысушылардың орташа (± sd) жасы 31.10 (± 11.82) жыл болды.
Бұл зерттеуде Ковид-19 сынағы оң және теріс қарқыны анықталды. Thus, the positive rates of the Abbott SARS-CoV-2 assay, Daan Gene 2019-nCoV assay, SARS-CoV-2 BGI assay, and Sansure Biotech 2019-nCoV assay were 59.1%, 58.5%, 57.9% and 55.5% respectively. Оң және теріс композициялық стандарт (CRS) баллдары сәйкесінше 97 (59,1%) және 67 (40,9%) болды (1-кесте). Осы зерттеуде CRS анықтамасы «кез-келген оң» ережеге негізделді, содан кейін төрт тест нәтижелері жоқ, сол нәтиже берген екі немесе одан да көп сынақ нәтижелері нақты оң немесе теріс деп саналды.
Бұл зерттеуде біз CRS-пен салыстырғанда барлық талдаулар үшін 100% (95% 94.6-100) теріс пайыздық келісімді (NPA) таптық. Санбюльдік биотехнологиялық талдау 93,8% (95% 87,2-97.1) минималды PPA-ны көрсетті, ал Daan гене гені 2019-NCOV талдау 99,4% (95% 96.6-99.9) құрады. Керісінше, SARS-COV-2 BGI BGI Assay Assay және Sansure Biotech 2019-НКОВ талдауы арасындағы жалпы келісім, сәйкесінше 98,8% және 96,3% құрады (2-кесте).
Cohen's Kappa CRS және Abbott Sars-Cov-2 талдау нәтижелері толығымен дәйекті болды (k = 1.00). Сол сияқты, Коэннің Каппа құндылықтары Daan gene 2019-NCOV, SARS-COV-2 BGI, ал «Biotech 2019-NCOV» АҚ-да CRS (K ≥ 0.925) анықталған. Осы салыстырмалы талдауда CHI-SORGOR тестісі (McNemar Test) Sansure Biotech 2019-НКОВ талдау нәтижелері CRS нәтижелерінен айтарлықтай ерекшеленді (P = 0.031) (2-кесте).
Суретте көрсетілгендей1 ABBOT SASS-CAV-2 талдау (біріктірілген RDRP және N ген) генінің пайыздық мөлшерлемесі (біріктірілген РДРК және N ген) zen гендік мөлшері (<20 КТ) (<20 КТ) 50,3%, ал жоғары CT мәні (36-40 CT) 3,2% құрады. 1 ABBOT SASS-CAV-2 талдау (біріктірілген RDRP және N ген) генінің пайыздық мөлшерлемесі (біріктірілген РДРК және N ген) zen гендік мөлшері (<20 КТ) (<20 КТ) 50,3%, ал жоғары CT мәні (36-40 CT) 3,2% құрады.Суретте көрсетілгендей1, процент Наименьшего Значения СТАЧЕНИЯ АББОТСА АББОТС-2 (Комбинированный Ген және N) Составил 87,6%, А 77,6%, А-зена CT ГЕНА ORF1A / B Анализа Sansure Biotech 2019-НКОВ Показало Чточо процент никого значения CT (<20 CT) Составлял 50,3%, А высокое значение CT (36-40 CT) Составланло 3,2%. 1, ABBOT SARS-CAV-2 (CT) CT (<20 CT) талдауының пайыздық мөлшері (CT) 87,6%, ал CT1A / B-тің CT мәні (<20 CT) (<20 CT) (<20 CT) 50,3%, ал 3,2% құрады.. 1-суретте көрсетілгендей, CT-дің ең төменгі пайыздық мөлшері (<20 CT) ABBOTT SARS-COV-2 сынағы (RDRP және N ген) CT Сансурь биотехнологиялық тестілеуі 87,6% (<20 CT) 的 пайызы 50,3%, 高 CT 值 (36-40 CT) 的 пайызы 3,2% құрайды. Как показано На Рисуке 87,6%, А зена orf1a orf1a / b / b / b / b / b / b ransuldovanii sansure biotech 2019- Анализ НКОВ Показал Никин CT. 1-суретте көрсетілгендей, Abbott Sars-Chars-2 талдау (RDRP және N гендерін) 87,6% деңгейінде (<20 КТ) 87,6% деңгейінде, ал «ORF1A / B генінің» CT мәні - NCOV-дің талдауы төмен CT-ді көрсетті. Процент значений (<20 CT) составил 50,3%, А процент высоких значений CT (36-40 CT) Составил 3,2%. Құндылықтың үлесі (<20 КТ) 50,3%, ал жоғары CT мәндерінің үлесі (36-40 т.с.) 3,2% құрады.ABBOT SARS-COV-2 B тестілеуі CT мәндерін 30-дан асады. Екінші жағынан, BGI SARS-CAV-2-де orf1a / b генінде жоғары CT мәні (> 36 CT) пайызы 4% құрады (Cурет 1). Екінші жағынан, BGI SARS-CAV-2-де orf1a / b генінде жоғары CT мәні (> 36 CT) пайызы 4% құрады (Cурет 1). С другой стороны, в анализе Екінші жағынан, BGI SARS-2 гендер-2 гені ORF1A / B талдауында CT мәні (> 36 CT) болды, оның үлесі 4% құрады (1-сурет).另一方面, 在 BGI SAVS-2 检测中, ORF1A / B 基因具有高 CT 值 (> 36 CT) 的百分比为 4% (图 1). Екінші жағынан, BGI SARS-COV-2 анықтау кезінде, жоғары CT мәні бар ORF1A / B генінің пайызы (> 36 CT) 4% құрайды (1-сурет). С другой стороны, в анализе Екінші жағынан, BGI SARS-COV-2 анализінде, жоғары CT мәндері бар ORF1A / В гендерінің пайызы (> 36 CT) 4% құрады (1-сурет).
Осы зерттеуде біз 164 мұрын-назофарингальды үлгілерді алдық. Ассейзацияның барлық түрлері үшін, РНҚ оқшаулау және күшейту тиісті өндірушілер ұсынған әдістер мен жиынтықтардың көмегімен жүргізілді.
Бұл зерттеу SARS-COV-2 үшін абботтың сынағы CRS ретінде бірдей үлгерім бар екенін көрсетті, 100% оң, теріс және жалпы келісімі бар. Cohen's Kappa келісімі - CRS-пен толық келісімді көрсете отырып, 1.00. Вашингтон университетінің АҚШ-та осындай зерттеуі АҚШ-та Сарс-Ков-2 үшін аббот сынағының ерекшелігі мен CDC зертханалық анықталған талдауларымен салыстырғанда 93% және 100% құрады деп тапты. 11. ABBOT SARS-COV-2 анықтау жүйесі бір мезгілде N және RDRP гендерін құруға негізделген, өйткені екі гендер де сезімтал, жалған негативтерді азайтады. Сондай-ақ, Австрия Вена, Вена, Австрия сонымен қатар үлкен өндіру үлгілерінің көлемі мен айқындаудың тиімділігі аз мөлшерде сұйылту әсерлері мен анықтама тиімділігінің артуын көрсетті13. Осылайша, Abbott-тің SARS-COV-2 талдауы үшін тамаша матчты платформаны анықтау жүйесімен байланысуға болады, бұл комбинацияны анықтау жүйесімен байланысты болуы мүмкін, бұл бір уақытта комклюзивті гендерді анықтайды, көптеген үлгілерді (0,5 мл) алады және көп мөлшерде eleuent (40 мкл) қолданылады.
Біздің нәтижелеріміз сонымен қатар Daan генетикалық тестінің анықталу өнімділігі CRS-пен бірдей болғанын көрсетті. Бұл Хуанань, Қытайда Анхуи университетінде өткізілген14 оқуына сәйкес келеді және өндірушінің 100% оң келісімге қатысты талаптары. Тұрақты нәтижелер туралы хабардар болғанына қарамастан, бір үлгі сол этиканы қайта тексергеннен кейін жалған теріс болды, бірақ ABBOT SARS-COV-2 және Biotech Ncov-2019 Sansure Biotech Ncov-2019 Sansuch Бұл әр түрлі талдау түрлері бойынша нәтиже алуы мүмкін деп болжайды. Дегенмен, Қытайда жүргізілген зерттеуде 15-те жүргізілді15, Daan гендік талдау нәтижесі (P <0,05) зертханалық анықтамалық талдауларымен салыстырғанда едәуір ерекшеленді (P <0,05). Дегенмен, Қытайда жүргізілген зерттеуде 15-те жүргізілді15, Daan гендік талдау нәтижесі (P <0,05) зертханалық анықтамалық талдауларымен салыстырғанда едәуір ерекшеленді (P <0,05). Тем не мегене, в исследовании, проведенном в китае15, результан анализа Daan gene gene gene gene gene gene gene gene gene gnachitelno (р) Эталонного анализа. Алайда, China15-те, Daan генінің талдау нәтижесі зертханалық анықтамалық талдаулардан едәуір ерекшеленді (P <0,05).然而, 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异 (P <0.05).然而, 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差 <0,05 Однако в Исссловании, Проведенном в китае15, резултаты Генетикалық теста Daan znachitelno Daan znachitelno отльичались (P <0,05) по сравнию Его эталонным лаборатекторным Тестом. Алайда, China15-те зерттеулерде Даанның генетикалық сынағының нәтижелері едәуір өзгеше болды (P <0,05), оның анықтамалық зертханалық сынақтарымен салыстырғанда айтарлықтай ерекшеленді (P <0,05).Бұл сәйкессіздік SARS-COV-2 анықтау үшін анықтамалық тестің сезімталдығына байланысты болуы мүмкін, ал одан әрі зерттеулер себебін анықтау үшін маңызды болуы мүмкін.
Сонымен қатар, біздің зерттеуіміз «SARS-COV-2 BGI-2) CRS-пен салыстырмалы өнімділікті бағаладық, оң пайыздық келісім (PPA = 97,9%), теріс пайыздық келісім (NPA = 100%), және гендерлік (OPA) жалпы пайыздық келісім. ). = 98,8%). Коэннің Каппа мәндері жақсы келісім көрсетті (k = 0.975). Netherlands16 және China15 зерттеулері дәйекті нәтиже көрсетті. SARS-COV-2 BGI сынағы - бұл 10 мкл күшейту / анықтауды пайдалану арқылы бір ген (ORF1A / B) анықтау сынағы. Біздің анықтамалық нәтижелермен жақсы статистикалық келісімге қарамастан, талдау жалпы үлгінің екі оң үлгіні (1,22%) жіберіп алды. Бұл пациенттің де, қауымдастығында да тарату динамикасына үлкен клиникалық әсер етуі мүмкін.
Осы зерттеуге енгізілген тағы бір салыстырмалы талдау «Биотехнология» НКОВ-2019 RRT-PCR (RUO) талдауы болды; Жалпы матчтың пайызы 96,3% құрады. Келісімнің беріктігін Коэннің Каппа құнымен анықтады, бұл CRS-пен толық келісімді көрсете отырып, 0.925 болды. Біздің нәтижелеріміз, біздің нәтижелеріміз Чанша, Қытай және Люжоу Халық ауруханасының, Люжоу қаласындағы гуманитарлық бөлімшелерінде және Қытайдың клиникалық зертханасында жүргізілген зерттеулермен байланысты, олар Қытай17. Жоғарыда аталған жақсы статистикалық келісім жазылған болса да, Чи-квадрат тест (Macnemar Test) Сансураның нәтижесі «биотехникалық талдау» нәтижесінде CRS-пен салыстырғанда статистикалық маңызды айырмашылық бар екенін көрсетті (P <0.005). Жоғарыда аталған жақсы статистикалық келісім жазылған болса да, Чи-квадрат тест (Macnemar Test) Сансураның нәтижесі «биотехникалық талдау» нәтижесінде CRS-пен салыстырғанда статистикалық маңызды айырмашылық бар екенін көрсетті (P <0.005). НЕСМОТРЯ ТО, Что Было Зафиксировано указанное вышо выше выше выше выше Макнемара) Показал, что результанг анализа-салыг Жоғарыда айтылған жақсы статистикалық келісім жазылғанмен, Чи-квадрат тест (McNemar Test) Sansure Biotech Assay нәтижесінде CRS (P <0.005) салыстырғанда статистикалық маңызды айырмашылық болғанын көрсетті.尽管记录了上述良好的统计一致性, 但卡方检验 (Macnemar 检验) 表明, Sansure Biotech 检测的结果与 CRS 相比具有统计学显着差异 (P <0.005).尽管 记录 了 上述 上述 良好 统计 一致性, 但但 ((Macnemar 检验 表明, Sansure Biotech 检测 结果 结果 结果 结果 与 与 与 相比 显着 显着具有 ((P <0.005 .................)))))))))) Несмотря на Омеченное вышечее сточе сортистическое соотвие, критерий Хи-Квадрат (Критерий макнеемара) Показин Статистически значимюю разницу (P <0,005) медалу Ажду анализомы Сансурь биотехникалық және CRS. Жоғарыда айтылған жақсы статистикалық келісімге қарамастан, Chi-Square Test (McNemar Test) статистикалық маңызды айырмашылықты (P <0.005) семіздік биотехникалық талдау және CRS арасында көрсетті.Алты сынамалар (3,66%) CRS-пен салыстырғанда жалған негативтер деп табылды (қосымша кесте); Бұл өте маңызды, әсіресе вирустың берілу динамикасын ескере отырып. Жоғарыда келтірілген деректер сонымен қатар бұл төмен анықтау жылдамдығын қолдайды15.
Бұл зерттеуде CT мәндері әр талдау және тиісті платформа үшін анықталды. Бұл нәтиже SARS-COV-2 анықтауға арналған бір мезгілде бірлескен генетикалық тестілеу жүйесіне қатысты болуы мүмкін. Сондықтан, 1-графиктің 87,6% -ы ABBOTT SASS-2 нәтижелерінің 87,6% -ы 20-дан төмен. 30-дан жоғары CT мәні жазылмаған. Abbott-тің панель-2 панельдік генетикалық тестілеу форматынан басқа, бұл нәтиже бұл нәтиже (32.5 RNA көшірмелері / мл) 18, бұл компанияның 100 RNA көшірмесінен үш есе төмен, бұл 100 RNA көшірмесінен үш есе төмен. ML) 19.
Бұл зерттеуде бірнеше шектеулер бар: біріншіден, бізде стандартты / анықтамалық әдістер жоқ [мысалы, вирустық жүктеме немесе басқа зертханалық зерттеулер (LDA), басқа зертханалық зерттеулер (LDA)) ресурстардың болмауына байланысты. Екіншіден, осы зерттеуде қолданылатын барлық үлгілерде, насофарингеальды тампондар болды, ал нәтижелер басқа үлгілердің түрлеріне, үшіншіге қолданылмады, үшінші, біздің үлгі өлшемі аз болды.
Бұл зерттеу NasopharyNugal үлгілерін қолдана отырып, SARS-CCR үшін төрт RRT-PCR үлгерімін салыстырды. Барлық анықтауға арналған талдаулар смансич биотехникалық талдауын қоспағанда, салыстырмалы өнімділігі болды. Сонымен қатар, төменде көрсетілгендей, төмен позициялар деңгейі CRS (P <0.05) салыстырмалы түрде биотехникалық талдауда анықталды. Сонымен қатар, төменде көрсетілгендей, төмен позициялар деңгейі CRS (P <0.05) салыстырмалы түрде биотехникалық талдауда анықталды. КРОМЕ ТОГО, в Тесте салыгы BioTech Bilyech Bily vynevlen Низкий процент полцент полцент Положительных результатов по сравнению және CRS (P <0,05). Сонымен қатар, Сансурь биотехникалық тестілеуі CRS-пен салыстырғанда оң нәтижелердің төмен пайызын көрсетті (P <0,05).此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低 (P <0.05).此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低 (P <0.05). КРМЕ ТОГО, АНАЛИЗДІҢ САНУЗЫ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛ БОЛЕЛЬЕЙ УРОВОВОВОВЕНЬ Положительных результатов по сравнению С CRS (P <0,05). Сонымен қатар, Сансуралық биотехнологиялық талдау CRS (P <0,05) салыстырғанда төмен позитивті деңгейге ие болды.«Биотехнология» қорығы «БК» қоры (RUO) PPA, NPA және жалпы келісім 93,5% -дан асып түсті, Коэн Каппа келісімінің коэн Каппа күші 0,925-тен асып түсті. Соңында, «Биотехникалық талдау» (RUO) Салы (RUO) Эфиопияда қолдану үшін одан әрі тексеруді қажет етеді, ал жеке өндірушілердің шағымдарын бағалау үшін қосымша зерттеулер қажет.
Салыстырмалы зерттеу дизайны Addis Ababa, EKA Koteba ауруханасында, Мыңжылдық шіркеуді емдеу орталығы, Зьюудиту мемориалдық ауруханасы және Сент-Питер Туберкулез маманының ауруханасында жүргізілді. Деректер жиналды, 2020 жылғы 1 мен 31, 31, 31, 31 желтоқсан аралығында жиналды. Осы зерттеуге арналған медициналық мекемелер өздерінің көп жағдайда олардың көп жағдайда және қаладағы негізгі емдеу орталықтарының қол жетімділігі негізінде таңдалды. Сол сияқты, ABI 7500 және ABI 7500 және ABBOT 7500 және ABBOTT M2000 ABBOTT M2000 құралдарын, осы зерттеу үшін таңдалды, өйткені бұл зерттеу үшін ПТР-дің төрт жиынтығы таңдалды, өйткені эфиопиядағы ең көп дегенде, кем дегенде төртеуі. Генді сынақ, Abbott Sars-Chest-2 сынағы, салыгы биотехникалық тест, ал SARS-COV-2 BGI сынағы).
SARS-COV-2-ге тестілеу 1-30 желтоқсан аралығында 2000-нан 2020 жылғы 20 желтоқсаннан бастап, 3 мл вирустық көлік ортасының (ВТМ) (ВТМ) (ВТМ) (ВТМ) (Мирацлен технологиясы, Шэнержен, Шэнержен, Қытай) Ефиге сілтеме жасады. Насоқарнегалеальды үлгілерді оқытылған үлгі коллекторлары жинады және үштік пакетте EPHI-ге жіберді. Нуклеин қышқылын оқшаулау алдында әр үлгіге бірегей сәйкестендіру нөмірі беріледі. Шығару әр үлгіден қолмен және автоматты экстракция әдістерін қолдана отырып жүзеге асырылады. Осылайша, ABBOTT M2000, 1,3 мл (оның ішінде 0,8 мл өлі көлемі және 0,5 мл экстракцияның кіріс көлемі) үшін әр үлгіден алынып, ABBOTT DNA үлгісін дайындау жүйесінен шығарылды (ABBOTH MOLECURAL Inc. DES PLANES, IL, АҚШ). ) 96 [92 үлгіні, екі детелекторды басқаруды және екі шаблон емес басқаруды (NTC) нақты уақыт режимінде SARS-COV-2 (EUA) (EUA) екі раундының жалпы процестеріне (алу) (алынуы) (алу)) енгізді. Тау-кен өндірісі. Сол сияқты, қолмен алу үшін бірдей үлгілерді қолданыңыз (автоматты экстракция және ашу үшін). Осылайша, процесс барысында Qiamamp Virlal RNNA MINI Kit (Qiagen GmbH, Hilden, Hilden, GmbH, Германия), 24 (оның ішінде 20 үлгіні, екі талдауды және екі NTC) пайдаланып, 140 мкл үлгілері алынды. Қолмен шығарылған қондырғылар ABI 7500 жылу циклін қолдана отырып, SARS-COV-2 BGI Assay, Daan гендік талдау және салыт биотехникалық талдауын қолдана отырып, ABI 7500 жылу циклін қолдана отырып анықталды және анықталды.
SARS-COV-2 вирустық RNN-ны автоматтандырылған оқшаулау және тазарту ABBOTT DNA үлгісін дайындау реагенттерін қолдана отырып, магниттік бисердің негізгі принципін ұстанады. Үлгілерді инактивациялау және вирустық бөлшектерді шешулендіруі протеин мен инактивациялы RNase-ді мойындамау үшін гуанидин изоциосыны бар жуғыш затты қолдану арқылы жүзеге асырылады. Содан кейін РНҚ ақуыздан кремниймен бөлінеді, кремний, яғни гуанидиний тұзы және лизис буферінің сілтілі рН нуклеин қышқылдарының кремнийлеріне (SiO2) байланыстыруға ықпал етеді. Шаю қадамы нақты шешім шығару үшін қалған ақуыздар мен қоқыстарды жояды. Мөлдір РНҚ Құралдың магнит өрісін пайдаланып, кремний негізіндегі микробөлшектерден оқшауланған. 20,21. Екінші жағынан, РНҚ-ны қолмен оқшаулау және тазарту спин бағанының әдісі, магниттік стендтің орнына центрифугацияны қолдана отырып жүзеге асырылады.
Abbott нақты уақыттағы SARS-COV-2 анықтау тесті (ABBOTH MOLECURAL, Inc.) ДДҰ мен FDA-дан EUA19,22-ге ие болған өндірушінің нұсқауларына сәйкес жүргізілді. Осы Хаттамада су ваннасында 56 ° C температурада 30 минут өткенге дейін инактивация жасалды. Вирусты инактивациядан кейін, нуклеин қышқылын өндіру ABBOT M2000 SP құралында 0,5 мл ВТМ-дан, ABBOT M2000 DNA үлгісін дайындау жүйесін қолдана отырып, 0,5 мл vtm құралында жасалды. өндірушінің айтуы бойынша. Күшейту және анықтау ABBOT M2000 RT-PCR құралының көмегімен жүргізілді және rdrp және n гендер үшін қос анықтама жасалды. Ішкі бақылауды және анықтауға арналған Vic P (меншікті бояу) және ішкі бақылауды анықтау үшін, екі күшейту өнімдерін бір уақытта анықтауға мүмкіндік береді.
Бұл жинақтың күшейту әдісі бір сатылы RT-PCR технологиясына негізделген. ORF1A / B және N гендері металлургия аймағын күшейту үшін Daan ген технологиясы бойынша сақталған аймақтар ретінде таңдалды. Белгілі бір праймерлер мен флуоресценттік зоненттер (Fam, Orf1a / B) белгісі бар гендік зондтар (gen, odf1a / b) сынамаларда SARS-COV-2 RNN-ді анықтауға арналған. Қорытынды элуент пен шебер қоспалары 5 мкл 20 мклден 20 мкл қосқышқа дейін дайындалды, ал соңғы көлемге 25 мкл дейін араластырыңыз. Күшейту және анықтау бір уақытта ABI 750024 нақты уақыттағы PCR құралында жүргізілді.
ORF1A / B және N гендері Sansure Biotech NCOV-2019 нуклеин қышқылының индексиндік жинағын (флуоресцентті анықтау) қолдана отырып анықталды. ORF1A / B аймағына арналған Fam арнасын және N ген үшін ROX арнасын таңдау арқылы әр мақсатты ген үшін нақты зондтарды дайындаңыз. Осы талдау жиынтығына, элюент және мастер-микс реагенттері келесідей қосылады: 30 мкл мкл мкл. ABI 750025 нақты уақыттағы PCR күшейту / анықтауға арналған.
SARS-COV-2 BGI Test - бұл ковид-19 диагнозындағы RRT-PCR-дің флуоресцентті реттегіші. Мақсатты аймақ SARS-COV-2 геномдық геномдық ORF1A / B аймағында орналасқан, бұл генді анықтау әдісі. Сонымен қатар, халық үйі gen-Actine go go-лар ішкі реттелетін нысаналы ген болып табылады. Мастер қоспасы 20 мкл мастер-реагентті және 10 мкл алынды RNN-нің 10 мкл сығындысы, ұңғыма табақшасында 26 мкл. Күшейту және анықтауға арналған ABI 7500 флуоресцентті сандық реттік PCR құралы пайдаланылды. Барлық нуклеин қышқылының күштенуі, ПТР әр талдау үшін орындалады және нәтижелерді түсіндіру өндірушінің нұсқауларына сәйкес жүргізілді (3-кесте).
Осы салыстырмалы талдауда біз төрт талдау үшін пайыздық келісімді (оң, теріс және жалпы) және басқа талдаудың басқа да салыстыру параметрлерін анықтау үшін анықтамалық стандартты әдісті қолданбадық. Осы зерттеуде CRS-пен салыстыру әр түрлі салыстыру жүргізілді, бұл «кез-келген оң» ереже бойынша қойылды және нәтиже бірыңғай тестілмейді, біз кем дегенде екі сәйкес сынақ нәтижесін пайдаландық. Сонымен қатар, Covid-19 тарату жағдайында жалған теріс нәтижелер жалған оң нәтижелерге қарағанда қауіпті. Сондықтан, «позитивті» деп айту үшін CRS нәтижесінен дәл айтуға, кем дегенде екі талдау екі түрлі болуы оң, бұл, кем дегенде бір оң нәтиже EUA талдауынан болуы мүмкін. Осылайша, төрт тест нәтижелері бойынша бірдей нәтиже беретін екі немесе одан да көп сынақ нәтижелері шынайы оң немесе теріс деп саналады18,27.
Деректер жиналды, деректерді шығару нысандары арқылы жиналды, деректерді енгізу және талдау, сипаттамалық статистика үшін Excel статистикалық бағдарламалық жасақтамасы мен SPSS 23.0 нұсқасы арқылы жасалды. Позитивті, теріс және жалпы пайыздық келісім талданып, әр әдіспен CRS-пен келісім дәрежесін анықтау үшін KAPPA ұпайлары пайдаланылды. Kappa мәндері келесідей түсіндіріледі: жұмсақтық үшін 0,01-ден 0.20-ға дейін, жалпы келісімге 0,21-ден 0.20-ға дейін, орташа келісімге 0,41-0.60, негізгі келісім үшін 0,61-0.80, ал жұмыс істемеуі үшін 0,61-0.80 және 0,81-0.99.
Этикалық тазарту ADDIS ABABA университетінен алынды және осы зерттеудің барлық тәжірибелік хаттамаларында Эфиопиялық денсаулық сақтау институтының ғылыми-зерттеу институтымен мақұлданды. EPhi Ethics лицензиясының анықтамалық нөмірі - EPHI / IRB-279-2020. Барлық әдістер Довид-19-ны емдеудің эфиопиялық ұлттық ұлттық жан-жақты нұсқауларының ұсыныстарына және ережелеріне сәйкес қолданылды. Сонымен қатар, оқуға қатысқанға дейін барлық зерттеу қатысушыларынан жазбаша келісімге келіп түскен келісім.
Осы зерттеуде алынған немесе талданған барлық мәліметтер осы жарияланған мақалаға енгізілген. Осы зерттеу нәтижелерін қолдайтын мәліметтер тиісті автордан ақылға қонымды сұрау бойынша қол жетімді.
Дүниежүзілік денсаулық сақтау ұйымы. Ковид-19-ға арналған зертханалық тестілеу стратегиялары: аралық басшылық, 21, 20 наурыз, № 21 наурыз. Кім / 2019-НКОВ / Lab_testing / 2020.1 (ДДҰ, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, КИВИД-19 АЖ КИВИД-19 Ақылды диагнозы: барлығы іс жүзінде. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, КИВИД-19 АЖ КИВИД-19 Ақылды диагнозы: барлығы іс жүзінде.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. және Gurgulianis, Ковид-19-дің К.И. ақылды диагностикасыMuliou DS, Pantazopoulos I. және Төтенше жағдайлар департаменттеріндегі Ковид-19 интеллектуалды диагностикасы, Ковид-19 интеллектуниялық диагнозы: практикада аяқталу. Сарапшы реверенд ресиндеуі. дәрі. 3, 263-272 (2022).
Митчелл, SL & ST GEORGE, K. Covid19 id қазір eua талдауы. Митчелл, SL & ST GEORGE, K. Covid19 id қазір eua талдауы.Митчелл, СЛ және Сент-Джордж, К. Ковсидтің бағалауы ЕОА талдауы.Митчелл СЛ және Сент-Джордж К. Дж. Клиникалық. Вирус. 128, 104429. Https://doi.org/10.1016/jcv.2020.10444429 (2020).
ДДСҰ. Адамның ауруына күдіктелген 2019 (Ковид-19) Коронавирустық ауруды зертханалық анықтау. https://www.who.int/pulationalication/i/item/10665-331501 (20 тамыз 2020) (ДДҰ, 2020).
Удугама, Б. және al. Ковид-19 диагнозы: аурулар және тестілеу құралдары. ACS NANO 14 (4), 3822-3835 (2020).
Syed S. және Al. Шығыс, Орталық және Оңтүстік Африка патологтар колледжінің құрылуы - Таяу Шығыс және Оңтүстік Африка патологиясы облыстық мектебі. Африка. Дж. Лаборатория. дәрі. 9 (1), 1-8 (2020).
Эфиопиялық денсаулық сақтау институты, Федералды Денсаулық сақтау министрлігі. ҚАБИЛ-19-ның аралық ұлттық стратегиясы және зертханалық диагностикасы бойынша нұсқаулық. https://epho.gov.et/images/novel_coronavirus/phi_pheoc_covid-19_haberatoratory_diagnose_gan.pdf.pdf (қол жеткізiнде 12 тамыз) (EPHI, 2020)
Волошин, С., Пател, Н. және Кессельхайм, SARS-COV-2 инфекциясы мен салдары үшін жалған теріс сынақтар ретінде. Волошин, С., Пател, Н. және Кессельхайм, SARS-COV-2 инфекциясы мен салдары үшін жалған теріс сынақтар ретінде.Волошин С., Пател Н. және Кесселххайм SARS-COV-2 инфекцияларына және олардың салдары үшін жалған-теріс сынақтар ретінде.Волошин С., Пател Н. және Кесселххайм, арандатуға арналған жағымсыз сынақтар және SARS-COV-2 инфекциясының әсері. Н.Н. Дж. Медицина. 383 (6), E38 (2020).
Mouliou, DS және Goulgoulianis, Ki жалған оң және теріс-теріс-теріс-теріс-19 жағдайлары: тыныс алудың алдын алу және басқарудың стратегиясы, вакцинация және одан әрі перспективалар. Mouliou, DS және Goulgoulianis, Ki жалған оң және теріс-теріс-теріс-теріс-19 жағдайлары: тыныс алудың алдын алу және басқарудың стратегиясы, вакцинация және одан әрі перспективалар. Mouliou, DS және Goulgoulianis, Ki Loznopolojitytelnye и ложноотельные случаи Вакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Goulgoulianis, Ki жалған оң және жалған жағымсыз жағдайлар: Тыныс алудың алдын алу және емдеу стратегиясы, вакцинация және алға ұмтылу.Muliu, DS және Gurgulianis, Ki жалған оң және жалған-жағымсыз-жағымсыз жағдайлар: Тыныс алудың алдын алу және емдеу, вакцинация және алға ұмтылу стратегиялары. Сарапшы реверенд ресиндеуі. дәрі. 15 (8), 993-1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, Г. Ковид-19 Диагноз, Г. Ковид-19 Диагностика: ағашты көру, бірақ орманды жоғалту. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, Г. Ковид-19 Диагноз, Г. Ковид-19 Диагностика: ағашты көру, бірақ орманды жоғалту.Mouliou, DS, Ioannis, P. және Konstantinos, Г. Ковид-19 Диагноз ДИРЕКТОР ДИРЕКТИНГ: Ағашты қараңыз, орманды жоғалтыңыз.Muliou DS, Ioannis P. және Константинос Г. Пайда болады. дәрі. J. https://doi.org/10.1136/Emed-2021-21219 (2022).
Дегли-Ангели, E. E. SARS-COV-2 нақты уақыттағы аналитикалық және клиникалық нәтижелерін тексеру және тексеру. Дж. Клиникалық. Вирус. 129, 104474. Https://doi.org/10.1016/jcv.2020.1044444444444474 (2020).
Молла, Кадр, Афшар, Калантар-Нейстанаки, Д., Фазлалипур, М., AFLATONIAN, M. & Aflatoyian, B. ковид-19 аймағынан ковид-19 аймағынан ковид-19 аймағынан кәдімгі RT-PCR. Молла, Кадшар, А.А., Калантар-Нейстанаки, Д., Фазлалоуыр, М., М. және AFLATONIAN, B. ковид-19 аймақтарынан ковид-19 аймақтарынан кәдімгі RT-PCR-дан жасалған әр түрлі геномдық аймақтарды салыстыру.Молла, Кадр, А.А., Калантар-Нейстанаки, D., Fazlalipour, M. және AFLATUNYAN, B. ковид-19 жылдар жиынтығын ковид-19-ның бес жиынтығын ковид-19-ның бес жиынтығын кәдімгі RT-PCR вирустық инфекциясын анықтауға арналған бес жиынтығын салыстыру. Моллае, сағ, АФШАР, А.А., Калантар-Нейстанаки, Д., Фазлалпур, М. және AFLATONIAN, B. 比较来自 Covid-19 不同基因组区域的五个引物组, 用于通过常规 RT-pcr 检测病毒感染. Моллае, Кадр, А.А., Калантар-Нейстанаки, Д., Фазлипур, М., Фазлалипур, М. және AFLATONIAN, B. ковид-19-ның дәстүрлі инфекциясын кәдімгі RT-PCR-ді анықтау үшін Ковид-19-нің 5 түрлі генетикалық аймақтарын салыстыру.Моллаэ Х.Р., Афшар А.А., Калантар-Нейстанаки Д, Фазлалипур М. және AFLATUNYAN В.Иран. J. микробиология. 12 (3), 185 (2020).
Голзцер, И. және al. SARS-COV-2 геневтік тізбегін анықтау үшін ұлттық сыртқы сапа бағалау бағдарламасының алдын-ала нәтижелері. Дж. Клиникалық. Вирус. 129, 104537. Https://doi.org/10.1016/jcv.2020.1044537 (2020).
Ванг, М. және al. Коронавирустың қатты жедел респираторлық синдромы үшін бес RT-PCR жиынтықтарының тиімділігін аналитикалық бағалау 2. J. Клиникалық. Зертхана. Анус. 35 (1), e23643 (2021).
Ванг Б. және al. Жеті полимеразы тізбекті реакциясы негізінде Қытайдағы SARS-COV-2 RNA-ның жеті сатылымының жиынтығын бағалау (ПТР). Клиникалық. Химиялық. Зертхана. дәрі. 58 (9), E149-E153 (2020).
Ван Кастерен, ПБ және басқалар. Жеті коммерциялық RT-PCR COVID-19 диагностикалық жинақтарын салыстыру. Дж. Клиникалық. Вирус. 128, 104412 (2020).
LU, Ю, Е және басқалар. SARS-COV-2 нуклин қышқылдарын анықтауға арналған екі ПТР жиынтықтарының диагностикалық қойылымын салыстыру. Дж. Клиникалық. Зертхана. Анус. 34 (10), E23554 (2020).
Лефарт, PR және т.б. Төрт сады-Ков-2 нукле қышқылының күшейтілуін сынау (NAAT) платформаларын салыстырмалы зерттеуде қазірдің өзінде пациентке және үлгі түріне қарай идентификатор айтарлықтай төмендеді. Диагноз. Микробиология. Жұқтыру. дозалау. 99 (1), 115200 (2021).
Аббот молекуласы. ABBOTT нақты уақыттағы SARS-COV-2 талдау пакетіне арналған. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infective-disasease-disaseaseaseaseaseasease-Disaseaseaseaseaseaseasease--saysay. 1-12. (2020 жылғы 10 тамыздағы жағдай бойынша) (2020).
Клейн, S. және Al. SARS-COV-2 RNNA RNA-ны RT-QPCR және RT-QPCR және RT шамымен жылдам ауқымды анықтауға арналған магниттік моншақтарды қолдану арқылы оқшаулау. Вирус 12 (8), 863 (2020).