中文网站
NAD MED | Кіріктірілген ісіктерді салыстыруға, иммундық және микробтық ландшафтқа салыстыруға көп емес тәсіл, иммундық жүйемен микробиоманың өзара әрекеттесуі көрсетілген
Алғашқы тоқ ішек қатерлі ісігінің биомаркерлері соңғы жылдары кеңінен зерттелгенімен, қазіргі клиникалық нұсқаулар тек ісік-лимфа-метастаздың аралық-метастаздарымен, ДНҚ-ны жөндеуге (MMR) (MMR) және MicroStellite тұрақсыздығы (MSI) (MSI) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) анықтау (стандартты патологияны тестілеуден басқа) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) анықтау (стандартты патологияны тестілеуден басқа) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) (стандартты патологияны тестілеуден басқа) анықтау. Зерттеушілер гендік өрнек негізіндегі иммундық реакциялар, микробтық профильдер, микробтық профильдер мен ісіктердің қатерлі ісік ауруындағы ісіктердің жоқтығын және қатерлі ісік ауруының қатерлі ісіктеріндегі ісіктер мен науқастың қатерлі ісігі және науқастың өмірі.
Зерттеулер алға қойғандықтан, бастапқы колоректальды қатерлі ісік ауруының сандық сипаттамалары, оның ішінде қатерлі ісік жасушаларының, иммундық, иммундық, сынған, немесе қатерлі ісік ауруының микробты сипаты клиникалық нәтижелермен айтарлықтай артта қалады, бірақ олардың өзара әрекеттесулерінің пациенттердің нәтижелеріне қалай әсер етеді.
Фенотиптік күрделілік пен нәтижелер арасындағы байланысты бөлу үшін, Катардағы Сидра медициналық зерттеулер институтының зерттеушілер тобы жақында микробтиомдық сипаттамалары бар науқастар тобын (микроскор) игерді және растады, ол микробиома сипаттамалары мен иммундық қабылдамау константаларын (ICR) біріктіреді. Команда алғашқы колоректальды қатерлі ісік ауруымен айналысатын 348 науқасқа, соның ішінде ісіктер мен сау колоректалдық тіндерден тұратын 348 науқастарға арналған геномдық талдау жасады, соның ішінде майлы репортаж, терең т-клеткалы рецептор және 16s бактериалды RRNA гендік репробиомасы, микробиоманы одан әрі сипаттаңыз. Зерттеу Табиғат медицинасында «Интеграцияланған ісік, интеграцияланған ісік, иммундық және тоқ ішек қатерлі ісігінің атласы».
Табиғатта медицинада жарияланған мақала
AC-ICAM шолу
Зерттеушілер ортогональды геномдық платформаны қолданып, жаңа мұздатылған ісіктердің үлгілерін және іргелес ішектің сау сподты матасын (ісік қалыпты жұптары) жүйелік терапиясыз гистологиялық диагнозымен гистологиялық диагнозымен ауыратын науқастардан тұрады. Күнделікті, RNA-SEQ мәліметтерінің сапасын бақылау және инклюзивті критерийлерді тексеру, геномдық критерийлерді скрининг, 348 науқастың геномдық мәліметтері сақталып, 4,6 жыл ішінде төмен ағынды талдау үшін қолданылады. Зерттеу тобы Sidra-Lumc AC-ICAM бұл ресурсы: иммундық-қатерлі ісік-микробтиомиома өзара әрекеттесулеріне арналған карта және нұсқаулық (1-сурет).
ICR көмегімен молекулалық жіктеу
Иммундық-генетикалық маркерлердің модульдік жиынтығын алу, иммундық рак иммундық маркерлерінің иммундық тенденциясы (ICR), ғылыми-зерттеу тобы, оны әр түрлі қатерлі ісік түрлерін, соның ішінде меланома, қуық қатерлі ісігі және сүт безінің қатерлі ісігі арқылы басып шығару арқылы ИКР-ны оңтайландырды. Сондай-ақ, ICR сонымен қатар қатерлі ісік түрлері, соның ішінде сүт безінің қатерлі ісігінде иммунотерапияға жауаппен байланысты.
Біріншіден, зерттеушілер AC-ICAM COCAM COCAM Cohort-тің ICR қолтаңбасын қолданып, Coh гендік негізіндегі бірлескен тәсілдерді қолдана отырып, үш кластер / иммундық субстанцияға (ыстық ісіктер), Орташа ICR және ICR (суық ісіктер) (1b). Зерттеушілер консенсус молекулалық кіші түрлерімен (CMS), тоқ ішек қатерлі ісігінің транскриптомды жіктелуімен байланысты иммундық бейімділікті сипаттады. CMS категориялары CMS1 / Impune, CMSS2 / CMS2 / CMS3 / CMS3 / MMS3 / MMS3 / MMS3 / MMS4 / MMS4 / MMSENCHYMAL. Талдау көрсеткендей, ICR ұпайлары барлық CMS-тің барлық ішкі түрлеріндегі қатерлі ісік жасуша жолдарымен кері байланысқан және иммуносупрессивті және сынған жолдармен оң корреляциялар тек CMS4 ісіктерінде байқалды.
Барлық CMS-те, табиғи киллер (NK) Жасуша және T ұяшықтарының көптігі ICR жоғары иммундық ішкі түрлерінің көптігі жоғары болды, бұл басқа лейкоциттер жиынтығымен (1С-сурет) әр түрлі өзгергіштігі бар (1С-сурет).
1-сурет. Ак-ИКАМ зерттеу дизайнын, иммундыққа қатысты гендік қолтаңба, иммундық және молекулалық қоспа және аман қалу.
ICR ісіктерді байытылған, клоникалық күшейтілген Тжылдарды түсіреді
Ісік тінінің аналық азшылығы тек ісік антигендеріне арналған, бұл ісік антигендеріне қатысты болды (10% -дан аз). Сондықтан, Ішкі үтіктің көп бөлігі ToSterSter T ұяшықтарына (Costresser T ұяшықтары) деп аталады. Тромалды TCRS қосылған кәдімгі TCS-тің санымен ең күшті корреляция сынғыш жасушада және лейкоциттер субпопуляцияларында байқалды (RNA-SEQ анықтады), оны T Cell Subpopuls (2А-сурет) бағалауға болады. ICR кластерлерінде (жалпы және CMS жіктеу), иммундық SEQ TCRS-тің жоғары клоникасы ICR-жоғары және CMS SUBTYPE CMS1 / иммундық топтар (2С-тан), ICR-жоғары ісіктердің көп бөлігі бар. Бүкіл транскриптомды (IFNG, Stat1, IRF1, CCL5, CCL5, GZMA, GZMA, GZMA, GZMA, GZMA), CXCL10 (IMSCL10), гендердің қатарына оң жақ т.ғ.к. Иммуносек TCR клоникасы ісікке қарсы CD8 + маркерлерінің көмегімен байқалған корреляцияларға қарағанда көптеген ICR гендерімен тығыз байланысты (2F және 2G). Қорытындылай келе, жоғарыда көрсетілген талдау ICR қолтаңбасы ісіктің байытылған, ортақ күшейтілген Т ұяларының болуын және оның болжамды салдарын түсіндіруге мүмкіндік береді.
2-сурет. TCR метрикалары мен иммунитетті гендермен, иммундық және молекулалық қосқыштармен корреляция.
Дені сау және тоқ ішек қатерлі ісігінің тіндеріндегі микробиома құрамы
Зерттеушілер 246 науқастықтан алынған ісік пен сау қасық тінінен алынған ДНҚ-ны қолдана отырып, ДНҚ-ны ретке келтірді (3А-сурет). Тексеру үшін зерттеушілер қосымша ДНҚ-ға сәйкес келмеген қосымша 42 ісік үлгілерінен 16S RRNA гендік реттік мәліметтерді талдады. Біріншіден, зерттеушілер флораның салыстырмалы молдылығын матчтық ісіктер мен сау қасық сау тіндері арасында салыстырды. Салауатты үлгілермен салыстырғанда учаскелерде жақындайтын перфругендер айтарлықтай өсті (3A-3D). Альфа әртүрлілігінде (бір үлгідегі әртүрлілік және түрлердің әртүрлілігі және көп мөлшері) маңызды айырмашылық болған жоқ, ісік пен сау үлгілер арасындағы, ICR-төмен ісіктерге қатысты ICR-жоғары ісіктерде микробтық әртүрліліктің азаюы байқалды.
Микробтық профильдер мен клиникалық нәтижелер арасындағы клиникалық байланысты бірлескен бірлестіктерді анықтау үшін зерттеушілер 16S RRNA гендік реттегішін қолдануға бағытталған, бұл 16s RRNA гендік реттік стандарттарын, бұл өмір сүруді болжайды. AC-ICAM246-да зерттеушілер MBR классификаторлары деп аталатын нөлдік коэффициенттері бар (дифференциалды өлім қаупімен байланысты) 41 мүмкіндікті таңдайтын OS COX регрессиялық моделін басқарды (3F сурет).
Бұл жаттығуда Cohort (ICAM246), төмен MBR балл (MBR <0, төмен MBR) өлім қаупін едәуір төмен (85% )мен байланысты болды. Зерттеушілері төмен MBR (тәуекел) және ұзақ ОЖ арасындағы Ыстық ОЖ (ICAM42 және TCGA-COAD) бойынша ұзаққа созылған ОС қауымдастығын растады. (3-сурет) Зерттеу ісі эндогастриялық кокси мен МДР-ның ісіктері мен сау колон тіндеріне ұқсас күшті корреляция көрсетті.
3-сурет. Ісік және сау тіндердегі микробиома және iCR және пациенттердің өмір сүруімен байланыс.
Қорытынды
Осы зерттеуде қолданылатын көп емес омис тәсілі колоректальды қатерлі ісік ауруынан иммундық реакцияның молекулалық қолын мұқият анықтауға және талдауға және микробиома мен иммундық жүйенің өзара әрекеттесуін анықтайды. Ісік пен сау тіндердің терең TCR тізбесін ICR болжамдық әсері ісік байытылған және ісіктерді байытылған және мүмкін ісікке қарсы жасуша клондарын алу мүмкіндігіне байланысты болуы мүмкін.
AC-IPAM үлгілеріндегі 16s RRNA гендік реттегішін қолданып ісік микробиомасын талдау арқылы команда мықты болжамды микробиомдық қолтаңбаны (MBR тәуекелінің баллын) анықтады. Бұл қол ісік үлгілерінен алынғанымен, бұл қолтаңба науқастардың ішек микробиоматын құрамын алуға болатындығын ескере отырып, салауатты колоректум мен МБЖ тәуекелінің голдары арасында қатты корреляция болды. ICR және MBR ұпайларын біріктіре отырып, ішек қатерлі ісігі бар науқастарда өмір сүруді болжайтын көпомалық студенттер биомаркерін анықтап, растауға болады. Зерттеудің көпомалық мәліметтер базасы тоқ ішек қатерлі ісігінің биологиясын жақсы түсіну және жеке терапевтік тәсілдерді табуға мүмкіндік береді.
POST TIME: маусым-15-2023
Құпиялылық параметрлері